НИР на тему: «Адаптация биоинформатических и программных алгоритмов по селекции неоантигенов для применения в соответствии с индивидуальным медицинским назначением для лечения различных онкологических заболеваний с использованием мРНК-вакцин, включая расширение спектра онкологических нозологий, проведение исследования безопасности и иммуногенности у пациентов, а также подготовка комплекта документов на получение разрешения на использование индивидуализированных биотехнологических лекарственных препаратов (иБТЛП) по наиболее перспективным нозологиям»

106 836 402 ₽

Начальная цена

Размещено

25.06.2026 17:13:30 (МСК)

Дата начала подачи заявок

25.06.2026 17:13:30 (МСК)

Заявки до

07.07.2026 08:00:00 (МСК)

Окончание подачи через

10 часов 39 минут 17 секунд

Объекты закупки

Наименование товара, услуги, работы по КТРУ	Код позиции	Ед. изм.	Количество	Цена за ед. изм.	Стоимость, руб.
1-й этап Расширение программного кода дополнительными аналитическими модулями с интеграцией в ПО, обеспечивающими проведение дополнительных типов анализов с использованием генетических и транскриптомных данных	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	9900000	9900000
1-й этап Оптимизация программного конвейера в целях адаптации ПО для работы с данными пациентов с колоректальным раком, раком почки, немелкоклеточным раком легкого и раком молочной железы, а также с данными соответствующих релевантных животных моделях.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	4008578.67	4008578.67
1-й этап Проведение исследования и интеграции в ПО базового функционала клинико-диагностического дашборда на основе данных, получаемых по результатам работы программного конвейера	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	3942295.33	3942295.33
1-й этап Тестирование альтернативных инструментов поиска неоэпитопов	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	2377662	2377662
1-й этап Доработка механизма загрузки исходных данных секвенирования с привязкой к уникальному номеру пациента и указанием соответствующих геномных данных	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	1637745.33	1637745.33
1-й этап Сырые данные полноэкзомного секвенирования нормальной ткани и опухоли (80 образцов) с покрытием не менее 200x. Секвенирование должно быть проведено в формате парных прочтений с минимальной длиной прочтения 100 нуклеотидов.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	80	122000	9760000
1-й этап Сырые данные транскриптомного мРНК-секвенирования (65 образцов) - не менее 10 Гб. Секвенирование должно быть проведено в формате парных прочтений с минимальной длиной прочтения 100 нуклеотидов.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	65	86666.67	5633333.55
1-й этап Перечень неоантигенов и последовательности в форме мРНК для исследования их эффективности на сингенной мышиной животной модели Заказчика	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	2487828.67	2487828.67
1-й этап Проведение комплексный систематический анализ данных мировой научной литературы по доклиническим и клиническим исследованиям иммунотерапевтических препаратов, включая применение мРНК-вакцин	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	3778328.67	3778328.67
1-й этап Разработка программы научно-исследовательской работы, включающую проект протокола клинического применения, описание целевой группы, процедуры скрининга, критерии отбора (включения и исключения) пациентов, подходящих для участия в НИР и последующего производства и применения иБТЛП, предназначенных для применения в соответствии с индивидуальным медицинским назначением и специально изготовленных для конкретного пациента с целью персонифицированного лечения онкологических заболеваний с использованием мРНК-вакцин. Исследование в рамках настоящего договора будут проводиться на количестве до 30 пациентов	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	3418245.33	3418245.33
1-й этап Базовая версия регистра пациентов и формат для унифицированного сбора данных	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	3833412	3833412
2-й этап Высокопроизводительное секвенирование РНК (bulk/single-cell RNA-seq) биологического материала пациентов, отобранного в 5 динамических временных точках с целью оценки состава клеточных популяций, маркеров активации клеток, анализа функциональных сигнатур, оценки Т- и В-клеточных клонов, глубокого профилирования репертуара Т- и В-клеток	72.11.11.000	УСЛ ЕД	75	42000	3150000
2-й этап Определение цитокинов (IL-6, IL-10, TNF-α, IFN-γ)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	30	107333.33	3219999.9
2-й этап ELISpot – специфические Т-клетки (IFN-γ)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	15	99666.67	1495000.05
2-й этап Проточная цитометрия – выявление активированных цитотоксических Т-клеток (CD8+) и клеток памяти (CD4+)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	15	106333.33	1594999.95
2-й этап Биопсия остаточной опухолевой ткани при наличии и согласии пациента	72.11.11.000	УСЛ ЕД	15	142777.67	2141665.049
2-й этап Морфологическое исследование (после введения)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	15	71889	1078335
2-й этап Патологоанатомическое исследование биопсийного материала с применением иммуногистохимических методов (при наличии образцов)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	15	157889	2368335
2-й этап Коллекции биологических материалов пациентов (не менее 14 на одного пациента), в том числе мононуклеарной фракции крови пациентов в количестве двух вакуумных пробирок для забора венозной крови с гепарином объемом 10 мл при каждом визите пациента до введения вакцины, а также спустя через 7, 14 и 45 дней после последней вакцинации	72.11.11.000	УСЛ ЕД	210	3411	716310
3-й этап Доработанная версия регистра пациентов и формат для унифицированного сбора данных	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	1896662	1896662
3-й этап Разработатка модуля для подбора и включения в состав мРНК-препарата кодирующих последовательностей иммуномодуляторных молекул, обеспечивающих таргетное воздействие на конкретные этапы противоопухолевого иммунного цикла, на которых у пациента идентифицированы дисфункции, а также на коррекцию состояния истощения (экзост) эффекторных иммунных клеток	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	893312	893312
3-й этап Разработатка модуля для выявления клинически значимых молекулярных нарушений в опухоли пациента и формирования рекомендаций по назначению таргетных препаратов и ингибиторов контрольных точек иммунного ответа, в том числе в комбинации с мРНК-вакциной.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	874862	874862
3-й этап Разработатка модуля для автоматизированного выявления нарушений в системе презентации антигенов опухолевыми клетками	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	874945.33	874945.33
3-й этап Разработатка модуля поиска часто встречающихся мутаций и формирования списка универсальных антигены для наиболее часто встречаемых HLA-аллелей	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	927395.33	927395.33
3-й этап Разработатка модуля для отбора известных иммуногенных антигенов (recall-антигенов) с их последующей интеграцией в состав мРНК-конкатемера	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	846162	846162
3-й этап Интеграция в ПО базового модуля для проведения деконволюции с использованием транскриптомных данных дополнительного модуля расчета иммуногенности потенциальных неоэпитопов.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	869395.33	869395.33
3-й этап Доработка расширенного клинико-диагностического дашборда с целью представления развернутой информации о состоянии пациента (по данным геномного и транскриптомного анализов).	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	900145.33	900145.33
3-й этап Тестирование работоспособности ПО на открытых и на собственных данных, в том числе для оценки молекулярного портрета опухоли и ее микроокружения, а также моделей предсказания свойств неоэпитопов (иммуногенность, аффинность связывания, чужеродность).	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	883920.33	883920.33
3-й этап Доработка ПО (с учетом результатов тестирования), обеспечивающего отбор перспективных неоантигенов для создания персонализированных мРНК-вакцин.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	909045.33	909045.33
4-й этап Комплект пептидов, состоящий из 450 пептидов (30 пептидов на 15 пациентов)	72.11.11.000	УСЛ ЕД	450	27666.67	12450001.5
4-й этап Доработка технического функционала ПО, обеспечивающего выбор наиболее перспективных неоантигенов для персонифицированного лечения онкологических заболеваний с использованием мРНК-вакцин и создание версии для передачи в медицинские организации, в том числе поддержка английского языка интерфейса и сопутствующих документов.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	8024828.67	8024828.67
4-й этап Развертка расширенной версии ПО на вычислительных мощностях Заказчика.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	2134162	2134162
4-й этап Подготовка и подача комплекта документов по результатам проведенных исследований, а также оптимизации регламента производства и применения заявления с прилагаемыми документами и сведениями согласно Постановлению Правительства Российской Федерации от 24.02.2025 № 213.	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	3190078.67	3190078.67
4-й этап Завершение и обобщение результатов исследования безопасности и иммуногенности мРНК-вакцины у пациентов и выработка рекомендаций	72.11.11.000	УСЛ ЕД	1	4619412	4619412
Итого					106836402.32

Дополнительная информация

Наименование электронной площадки в сети Интернет

ЭТП Газпромбанк

Адрес электронной площадки в сети Интернет

Регион

Город

Категории

Контактные данные

Номер контактного телефона

7-499-1934371

Адрес электронной почты

tender@gamaleya.org

Ответственное должностное лицо

Карасева Т. А.

Организация, определяющая поставщика (подрядчика, исполнителя)

Организация, осуществляющая размещение

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ ИМЕНИ ПОЧЕТНОГО АКАДЕМИКА Н.Ф. ГАМАЛЕИ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

ИНН

7734013214

Почтовый адрес

123098, Москва, Гамалеи, дом 18

Место нахождения

Российская Федерация, 123098, Москва, УЛИЦА ГАМАЛЕИ, ДОМ 18